Tujuan strategis Program Studi Doktor Ilmu Pertanian adalah:
- Menghasilkan lulusan yang berkualifikasi Doktor Ilmu Pertanian yang memiliki kemampuan dalam mengembangkan konsep, ilmu, dan teknologi baru dalam bidang pertanian di lingkungan tropika lembab.
- Menghasilkan lulusan yang berkualifikasi Doktor Ilmu Pertanian yang memiliki kemampuan menggali dan memanfaatkan potensi sumberdaya alam di lingkungan tropika lembab dan lingkungannya untuk pembangunan pertanian melalui penelitian.
- Menghasilkan lulusan yang berkualifikasi Doktor Ilmu Pertanian yang mampu memimpin, mengelola dan mengembangkan penelitian di bidang pertanian di lingkungan Tropika lembab melalui pendekatan inter, multi atau transdisipliner.
- Menghasilkan penelitian yang produktif dalam menciptakan karya dan teknologi baru yang kreatif, inovatif dan berstandard internasional yang dapat di implementasikan ke masyarakat serta dapat mengatasi permasalahan di bidang pertanian di lingkungan tropis lembab dan berkontribusi pada peningkatan kesejahteraan masyarakat.